Organisatorische Interoperabiliteit gat over de manier waarop entiteiten hun bedrijfsprocessen, verantwoordelijkheden en verwachtingen op elkaar afstemmen om gezamenlijk overeengekomen en wederzijds voordelige doelen te bereiken. In de praktijk betekent organisatorische interoperabiliteit het documenteren en integreren of afstemmen van bedrijfsprocessen en de uitgewisselde relevante informatie. Organisatorische interoperabiliteit is er ook op gericht om aan de eisen van de gebruikersgemeenschap te voldoen door diensten beschikbaar, gemakkelijk identificeerbaar, toegankelijk en gebruikersgericht te maken.